Der größte Flughafen in Belgien ist der Flughafen Brüssel, auch bekannt unter dem Namen Zaventem. Es gibt jedoch noch weitere regionale Flughäfen in Belgien, die auch internationale Flüge zu verschiedenen Zielen in Europa anbieten, darunter diejenigen in Charleroi, Antwerpen, Ostende und Lüttich. Auf Grund der geringen Fläche Belgiens sind Inlandsflüge praktisch nicht vorhanden und werden ansonsten lediglich von Sportfliegern oder Geschäftsreisenden durchgeführt. Für Reisen innerhalb des Landes nimmt man eher den Zug.
Die meistgenutzten Flugstrecken führen daher eher zu europäischen Zielen. besonders beliebt sind Flüge nach Madrid, London oder Genf. Interkontinental sind es vor allem die Verbindungen nach New York, Washington und Tel Aviv, die eine regelmäßige Auslastung aufweisen können. Andere geschäftige Routen sind Antwerpen-London, Charleroi-Madrid, Ostende-Barcelona und Lüttich-Malaga. Belgiens internationale Flughäfen bieten somit Verbindungen zu allen Ecken der Welt, allerdings sind diese außerhalb der Saison meist eingeschränkt.
Brussels Airlines ist Belgiens nationale Fluggesellschaft und gleichzeitig auch die Größte. Mit Sitz am Brüsseler Flughafen bietet das Unternehmen Flüge zu 65 Zielen in verschiedenen europäischen Ländern, sowie Langstreckenflüge nach Nordamerika und Afrika an. Seit 2014 fokussiert das Unternehmen seine Bemühungen im Billigflugsektor, um mit Konkurrenten wie easyJet und Ryanair mithalten zu können. Andere große internationale Fluggesellschaften, wie Jetairfly und Thomas Cook Airlines, operieren ebenfalls vom Flughafen Brüssel aus und betreiben von dort auch ihr zentrales Drehkreuz. Der Flughafen Charleroi wird von Wizz Air, Flybe und Pegasus angeflogen, die ebenfalls internationale Ziele innerhalb Europas ansteuern.